Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF8Q9BRL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF8Q9BRL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms