Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP3Q9BQQ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP3Q9BQQ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms