Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms