Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms