Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSG101Q99816 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSG101Q99816 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSG101Q99816 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms