Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5SQ99766 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms