Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LYSTQ99698 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms