Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PITX2Q99697 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX2Q99697 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms