Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3CQ99613 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3CQ99613 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3CQ99613 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms