Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP1Q99575 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP1Q99575 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP1Q99575 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP1Q99575 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP1Q99575 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP1Q99575 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP1Q99575 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP1Q99575 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP1Q99575 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP1Q99575 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP1Q99575 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP1Q99575 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP1Q99575 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP1Q99575 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP1Q99575 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP1Q99575 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP1Q99575 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP1Q99575 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POP1Q99575 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP1Q99575 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP1Q99575 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POP1Q99575 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP1Q99575 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP1Q99575 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP1Q99575 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POP1Q99575 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POP1Q99575 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POP1Q99575 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP1Q99575 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP1Q99575 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP1Q99575 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP1Q99575 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POP1Q99575 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POP1Q99575 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP1Q99575 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP1Q99575 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP1Q99575 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP1Q99575 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POP1Q99575 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POP1Q99575 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms