Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT12Q99456 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms