Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMS19Q96T76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMS19Q96T76 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms