Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SIN3AQ96ST3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SIN3AQ96ST3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms