Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK5RAP2Q96SN8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDK5RAP2Q96SN8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP2Q96SN8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms