Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALS2CR12Q96Q35 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms