Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP4Q96PP9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms