Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT3

GUCD1, Protein GUCD1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1Q96NT3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GUCD1Q96NT3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GUCD1Q96NT3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GUCD1Q96NT3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms