Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF558Q96NG5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms