Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COG8Q96MW5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG8Q96MW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG8Q96MW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG8Q96MW5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG8Q96MW5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COG8Q96MW5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms