Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLPTM1LQ96KA5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms