Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDLIM2Q96JY6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDLIM2Q96JY6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDLIM2Q96JY6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms