Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPIP1Q96JH7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms