Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC12Q96J65 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC12Q96J65 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC12Q96J65 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms