Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED3Q96IU2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED3Q96IU2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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