Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC3Q96F86 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EDC3Q96F86 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EDC3Q96F86 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms