Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MALSU1Q96EH3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALSU1Q96EH3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms