Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM44Q96DX7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms