Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NXPE2Q96DL1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXPE2Q96DL1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1108.5 ms