Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RMDN1Q96DB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms