Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP4CQ96CF2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4CQ96CF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms