Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NKD1Q969G9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms