Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BHMTQ93088 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms