Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD50Q92878 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD50Q92878 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms