Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RGP1Q92546 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RGP1Q92546 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RGP1Q92546 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RGP1Q92546 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RGP1Q92546 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RGP1Q92546 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms