Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCG3Q8WXD2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG3Q8WXD2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms