Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCFD1Q8WVM8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCFD1Q8WVM8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms