Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC107Q8WV48 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms