Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
U2AF1L4Q8WU68 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
U2AF1L4Q8WU68 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2AF1L4Q8WU68 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms