Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF214Q8ND24 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF214Q8ND24 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms