Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARMIL3Q8ND23 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL3Q8ND23 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL3Q8ND23 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms