Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC197Q8NCU1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms