Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM87AQ8NBN3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM87AQ8NBN3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms