Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AVL9Q8NBF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AVL9Q8NBF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AVL9Q8NBF6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms