Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1BQ8NB78 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1BQ8NB78 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1BQ8NB78 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms