Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD53Q8N9V6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms