Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPA2Q8N8Q9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPA2Q8N8Q9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms