Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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LGI3Q8N145 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGI3Q8N145 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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LGI3Q8N145 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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LGI3Q8N145 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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LGI3Q8N145 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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LGI3Q8N145 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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LGI3Q8N145 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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LGI3Q8N145 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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LGI3Q8N145 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LGI3Q8N145 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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