Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXZ3

SP8, Transcription factor Sp8, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP8Q8IXZ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SP8Q8IXZ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP8Q8IXZ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP8Q8IXZ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP8Q8IXZ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP8Q8IXZ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP8Q8IXZ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP8Q8IXZ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms