Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KSR1Q8IVT5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KSR1Q8IVT5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms