Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
P3H3Q8IVL6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
P3H3Q8IVL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
P3H3Q8IVL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms